Programa Interunidades de Pós-Graduação em Bioinformática - UFMG - Contato
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ICB - UFMG
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Oferta do semestre atual

2º semestre de 2018

Disciplina/Prof(s)
Código/
Turma
CR/CH
Nat/
Nível
Horário e
Período
Local/sala
Algoritmos para Bioinformática II
Prof: Marcos Augusto dos Santos

Obs: Pré-requisito: Ter cursado Algoritmos I
DCC 907 - 01
04/60
OP
M/D
Início das aulas 06/09/18
ICEx

Ementa: Algorítmos para manipulação de cadeias, sequências e árvores com aplicações em Biologia Molecular. Aplicações da Teoria dos Grafos e Otimização. Ferramentas para bioinformática Bibliografia Setúbal, J., Meidanis, J. INTRODUCTION TO COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY, PWS Publishing Co., 1977 Gusfield, D., ALGORITHMS ON STRINGS, TREES AND SEQUENCES: COMPUTER SCIENCE AND COMPUTATIONAL BIOLOGY

Ambientes de Computação
Prof: Raquel Cardoso de Melo Minardi
DCC 909 - 01
04/60
OP
M/D
Seg: 14:55 às 16:35
Qua: 14:55 às 16:35

Início: 20/08/2018
Sala 2059 ICEx

Ementa: Introdução à computação. Ambientes de programação. Redes de Computadores. Banco de dados. Ambientes unix. Ambientes de alto desempenho. Bibliografia Variável inculindo textos e artigos abordando o tema computação e programação.

Elaboração de Trabalho Final
Prof: ---
TES000
00/0
--
M/D
---
---
Estudos de Genoma, Trasncriptoma e Proteoma
Prof: Glória Regina Franco
ICB838
04/60
OB
M/D
Ter: 14:00 às 16:00
Qui: 14:00 às 16:00

09/08/2018 a 06/12/2018
Auditório da Bioinformática F2/254

Ementa: Estudos do genoma: a estrutura dos genomas eucariotos e procariotos, os polimorfismos de DNA e métodos para sua detecção, a produção de marcadores físicos e genéticos, sequenciamento de genomas inteiros, a análise de genomas completos utilizando ferramentas de bioinformática, comparação de genomas, metagenômica, filogenia, origem das doenças genéticas e testes genéticos, terapia genética, desrupção e super-expressão gênica. Estudos do transcriptoma: o controle transcricional e pós transcricional da expressão gênica, construção de bibliotecas de cDNA, o estudo do transcriptoma por RNA-Seq, metodologias de detecção de transcritos, estudo da expressão diferencial de transcritos, a bioinformática no estudo do transcritoma e anotação gênica, os RNAs não codificadores, RNA interferência. Estudos do proteoma: o controle traducional e pós-traducional da expressão gênica, obtenção de mapas pepetídicos, metodologias de sequenciamento de proteínas, comparação do proteoma de células e a expressão diferencial de proteínas, redes de interação proteína-proteína, biologia sintética e biologia de sistemas. Bibliografia: Biologia Molecular Básica, Zaha A et al., 5ª Edição, Editora Artmed, Biologia Molecular do Gene, Watson JD et al., 7ª Edição, Editora Artmed e Artigos de revisão atuais publicados em periódicos como Nature, Science, Trends e outros

Probabilidade e Estatística para Bioinformática
Prof: Glaura da Conceição Franco
EST 869 - 01
04/60
OB
M/D
Seg: 13:30 às 15:10
Qua: 13:30 às 15:10

Início: 06/08/2018
sala 2024 ICEx

Ementa: O papel da Estatística nas áreas médica e biológica; Estatística descritiva e análise exploratória de dados; Introdução à probabilidade e sua aplicação na qualidade de testes diagnósticos; Modelos probabilísticos. Modelo binomial e modelo normal; Construção de faixas de referência; Noções básicas sobre inferência estatística: teste de hipóteses e intervalo de confiança; Comparação de dois grupos: inferência sobre duas médias e sobre duas proporções; Análise de variância; Estudo de associação de duas variáveis categóricas; Estudo de associação de duas variáveis quantitativas; Aplicações de regressão logística e de Cox. Bibliografia Campbell, M. J., Machin, D. (1993) Medical Statistics - A Commonsense Approach. 2 ed. New York: John Wiley. Glantz, S. A. (1992) Primer of Biostatistics. 3 ed. New York: Mcgraw-Hill. Hassard, T. H. (1991) Understanding Biostatistics. St.Louis: Mosby Yeas Book. Nogueira, M. L. G., Nunes, L. L. C., Pinto, D., Ribeiro, A. J. F., Silva, C. Q., Siqueira, A. L. (1995) Introdução à Bioestatística. Belo Horizonte: Departamento de Estatística/ UFMG. Soares, J. F., Siqueira, A. L. (2001) Introdução à Estatística Médica. Editora UFMG

Seminários em Bioinformática I - Palestras ministradas sobre pesquisas na área de Bioinformática
Prof: José Miguel Ortega
BIQ 858
01/15
OB
M/D
Sex: 14:00 às 16:00

---
Auditório da Bioinformática F2/254

Ementa: - Apresentação de seminários ministrados por alunos de Mestrado e Doutorado do Programa de Pós-Graduação em Bioinformática, de docentes da UFMG e convidados nacionais e internacionais, sobre pesquisas na área da Bioinformática.

Seminários em Bioinformática II - Palestras ministradas sobre pesquisas na área de Bioinformática
Prof: José Miguel Ortega
DCC 908 - 01
01/15
OB
M/D
Sex: 14:00 às 16:00

---
Auditório da Bioinformática F2/254

Ementa: - Apresentação de seminários ministrados por alunos de Mestrado e Doutorado do Programa de Pós-Graduação em Bioinformática, de docentes da UFMG e convidados nacionais e internacionais, sobre pesquisas na área da Bioinformática.

Seminários em Bioinformática III - Palestras ministradas sobre pesquisas na área de Bioinformática
Prof: José Miguel Ortega
ICB831 - 01
01/15
OP
M/D
Sex: 14:00 às 16:00

---
Auditório da Bioinformática F2/254

Ementa: - Apresentação de seminários de alunos de Mestrado e Doutorado do Programa de Pós-Graduação em Bioinformática, de docentes da UFMG e convidados nacionais e internacionais, na área de Bioinformática.

Seminários em Bioinformática IV - Palestras ministradas sobre pesquisas na área de Bioinformática
Prof: José Miguel Ortega
ICB832
01/15
OP
M/D
Sex: 14:00 às 16:00

---
Auditório da Bioinformática F2/254

Ementa: - Apresentação de seminários ministrados por alunos de Mestrado e Doutorado do Programa de Pós-Graduação em Bioinformática, de docentes da UFMG e convidados nacionais e internacionais, sobre pesquisas na área da Bioinformática.

Tópicos em Bioinformática II - Modelagem Molecular: A otimização de campos de força e suas aplicações para predição de estruturas e docking.
Prof: Rodrigo Bentes Kato, Sandeep Tiwari
BIQ 856 - 02
02/30
OP
M/D
Ter: 14:00 às 17:00
Qui: 14:00 às 17:00

Período: 06/11 a 29/11
Laboratório De Informática M1

Ementa: Conteúdo variável para cada turma

Tópicos em Bioinformática II - Software R para modelagem molecular
Prof: Lucianna Helene Silva dos Santos

Obs: A aula do dia 06/11 será ministrada na sala G423
BIQ 856 - 03
02/30
OP
M/D
Ter: 09:30 às 12:00
Qui: 09:30 às 12:00

Período: 11/10 a 04/12
Auditório da Bioinformática F2/254

Ementa: Descrição: O R é definido como um ambiente de programação com um conjunto integrado de ferramentas de software para manipulação de dados, cálculos e apresentação gráfica. O intuito dessa disciplina é apresentar o uso do R para visualizar dados obtidos de variados métodos de modelagem molecular como por exemplo o atracamento molecular e dinâmica molecular de forma eficiente e concisa. A disciplina é baseada no livro R for Data Science (r4ds.had.co.nz), que ensina a importar, colocar na estrutura mais útil, transformar, visualizar e modelar dados em R. A

Tópicos em Bioinformática II - Revisão, Manip de arquivos, aplicando comandos do Linux em Perl, A variável do tipo Hash, Sub-rotinas e Módulos/Pacotes.
Prof: Raphael Tavares da Silva

Obs: PR: ter cursado a disciplina "Introdução à Linguagem Perl para Bioinformática". Alunos com conhecimento prévio em Algoritmos e Programação e conceitos básicos em Linguagem Perl podem cursar a disciplina. Verificar com o professor sua proficiência.
BIQ 856 - 04
02/30
OP
M/D
Seg: 08:00 às 12:00
Qua: 08:00 às 12:00

29/10, 31/10, 05/11, 07/11, 12/11, 14/11, e 3/12
Laboratório de Informática M1 (ICB)

Ementa: Objetivo: Apresentar, treinar e debater conteúdos avançados da Linguagem Perl para resolver problemas inerentes à Bioinformática.

Tópicos em Bioinformática III - METAGENÔMICA
Prof: Aristóteles Góes Neto
BIQ 857 - 01
03/45
OP
M/D
Seg: 09h00 às 17h00
Ter: 09h00 às 17h00
Qua: 09h00 às 17h00
Qui: 09h00 às 17h00
Sex: 09h00 às 17h00

03/12/2018 a 10/12/2018
Bloco J2 Sala 223

Ementa: Conteúdo variável para cada turma

Tópicos em Bioinformática III - Princípios de Biotecnologia
Prof: Aristóteles Góes Neto

Obs: A aula do dia 25/10 será no Auditório da Bioinformática
BIQ 857 - 04
03/45
OP
M/D
Seg: 09:00 às 17:00
Ter: 09:00 às 17:00
Qua: 09:00 às 17:00
Qui: 09:00 às 17:00
Sex: 09:00 às 17:00

22 a 26/10/2018
Sala 102 CAD1

Ementa: Biotecnologia: conceito, histórico e interdisciplinaridade. Processos biotecnológicos. Organismos utilizados. Biotecnologia aplicada a Agropecuária, Indústria, Saúde e Meio Ambiente. Agências regulatórias e marcos legais. Empresas, Incubadoras e parques tecnológicos de Biotecnologia no Brasil. Biotechnology: An Introduction 1st (first) Edition. M. Pele, C. Cimpeanu WIT Press. 2012. A Indústria de Biociências Nacional: Caminhos para o Crescimento" (2011). Biominas Brasil e PricewaterhouseCoopers (PwC).

Tópicos em Bioinformática III - Redes Complexas
Prof: Aristóteles Góes Neto

Obs: Nos dias 06/11 e 09/11 as aulas serão no Auditório da Bioinformática F2/254 na parte da manhã
BIQ 857 - 05
03/45
OP
M/D
Seg: 09:00 às 17:00
Ter: 09:00 às 17:00
Qua: 09:00 às 17:00
Qui: 09:00 às 17:00
Sex: 09:00 às 17:00

05 a 09/11/2018
Sala 104 CAD1

Ementa: - Histórico. Exemplos de redes reais nas áreas de Ciências Biológicas, Exatas e Sociais. Termos e Conceitos. Estrutura de redes: Topologia, princípios matemáticos (teoria de grafos) e métricas. Modelos Teóricos de Redes Complexas (aleatória, mundo pequeno, livre de escala ou ligação preferencial). Dinâmica de redes (perturbações e resiliência). Referências: Livros: Network Science, by Albert-Laszlo Barabasi, (Cambridge University Press, 2016) - licença livre pela Creative Commons (online). Networks: An Introduction, by M. E. J. Newman, Oxford University Press, 2010. Artigos de revisão: The Structure and Function of Complex Networks, by M. E. J. Newman, SIAM Review 45 (2), 167-256, 2003. Programas: Análise de redes: NetworkX (python) http://networkx.lanl.gov/ Visualização de redes Gephi, Open source graph visualization GUI

Tópicos Especiais em Ciência da Computação - Visualização de Dados
Prof: Raquel Cardoso de Melo Minardi
DCC831 - 01
04/60
OP
M/D
Seg: 11:10 às 12:50
Qua: 11:10 às 12:50

---
CAD3 Sala 206

Ementa: Conteúdo variável para cada turma

TÓPICOS TRANSVERSAIS DE PÓS-GRAD. II - Conceitos de empreededorismo aplicados a bioinformática e biotecnologia
Prof: Tiago Antonio de Oliveira Mendes
DIP NAP801 - 01
02/30
OB
M/D
Seg: 08:00 às 12:00
Ter: 08:00 às 11:00
Qua: 08:00 às 12:00
Qui: 08:00 às 11:00
Sex: 08:00 às 12:00

24/09/2018 a 02/10/2018
Sala de Seminários do ICB/4ºandar G423
Treinamento Didático I
Prof: ---
ICB833
03/45
OP
M/D
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Ementa: Participação do estudante no ensino prático e teórico da Bioinformática, visando a aquisição de experiência para o exercício de suas atividades didáticas, sob orientação de professor tutor designado em comum acordo com o docente coordenador da disciplina

Treinamento Didático II
Prof: ---
ICB834
03/45
OP
M/D
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Ementa: - Participação do estudante no ensino prático e teórico da Bioinformática, visando a aquisição de experiência para o exercício de suas atividades didáticas, sob orientação de professor tutor designado em comum acordo com o docente coordenador da disciplina

Av. Antonio Carlos, 6627, Belo Horizonte - Minas Gerais, Brasil - 31270-901
Instituto de Ciências Biológicas - ICB - Bloco K4, Sala 163
Telefones: 55 (31) 3409-2554 / Fax: 55 (31) 3409-2614